Кейси Стоунър с Ducati бе най-бърз през повечето време, но австралиецът не постигна голямо подобрение в скоростта, когато смени твърдите гуми с меки за финалната битка за първото място и така остана четвърти зад Дани Педроса с Honda. Педроса бе първият, който успя да задмине Стоунър, но не можа да удържи дълго пред Роси и даде време от 1:33.408, което не му стигна за пол. Незначителна загуба на време, в средата на обиколката и забавяне от 0.054 сек., попречи на Лоренцо да вземе първото място на своя съотборник и успя да избута Педроса към третата позиция. Двете машини на Ducati завършха между първите пет, като Ники Хейдън изостана само 0.021s след своя съотборник Стоунър.
Ранди де Пюние от LCR Honda даде отлично време на родното си Гран При и взе място на втория ред, изпреварвайки Андреа Довициозо от Honda. Алекс Еспаргаро от Pramac Ducati, запази силната си форма от сутринта и успя да влезе в десетката, на опашка зад Колин Едуардс Tech 3 Yamaha и Лорис Капироси на Suzuki. Неговият съотборник Алваро Баутиста отпадна от състезанието след катастрофа на тренировките сутринта.
1. Valentino Rossi Yamaha 1m33.408s
2. Jorge Lorenzo Yamaha 1m33.462s + 0.054s
3. Dani Pedrosa Honda 1m33.573s + 0.165s
4. Casey Stoner Ducati 1m33.824s + 0.416s
5. Nicky Hayden Ducati 1m33.845s + 0.437s
6. Randy de Puniet LCR Honda 1m34.074s + 0.666s
7. Andrea Dovizioso Honda 1m34.204s + 0.796s
8. Colin Edwards Tech 3 Yamaha 1m34.304s + 0.896s
9. Loris Capirossi Suzuki 1m34.306s + 0.898s
10. Aleix Espargaro Pramac Ducati 1m34.514s + 1.106s
11. Marco Melandri Gresini Honda 1m34.523s + 1.115s
12. Ben Spies Tech 3 Yamaha 1m34.920s + 1.512s
13. Marco Simoncelli Gresini Honda 1m34.942s + 1.534s
14. Hiroshi Aoyama Interwetten Honda 1m34.979s + 1.571s
15. Hector Barbera Aspar Ducati 1m35.323s + 1.915s
16. Mika Kallio Pramac Ducati 1m35.810s + 2.402s