Така в семейство Маркес се появи още един световен шампион. Пилотът на Estrella Galicia 0,0 с мотоциклет Honda Moto3. Така след по-големия си брат Марк, Алекс спечели титлата в най-малкия клас и двамата станаха първите братя, сложили короната в един и същи сезон, макар и в различни класове. Алекс завърши 3-и, след победителя във Валенсия Джак Милър, който също бе претендент за титлата, като поожи усирлия да я спечели, но не успя. Втори стана Исак Винялес. Третото място на Алекс Маркес бе напълно достатъчно, за да триумфира с титлата и с 278 т. Само на две след него – 286 остана Милър.
Походът на Алекс Маркес към титлата започна след доста успешни зимни тестове, заедно с неговия съотборник Алекс Ринс. Така Маркес се почувство доста добре с новия си байк Honda. Двамата бяха първи и втори на старта в катар, а Алекс Маркес стана втори, след като направи малка грешка и позволи на Джак Милър от Red Bull KTM Ajo да го изпревари. Милър стана конкурент за титлата на Маркес, докато Робано Фенати и Ринс също печелеха състезания. На пистата в Остин, Маркес за първи път отпадна през сезона, докато Милър и Фенати натрупаха солидна преднина от точки. В Аржентина пилотът на Honda, се квалифицира 11-и, а Милър взе още една първа позиция. Маркес направо отлично състезание и стана втори, като не допусна Милър да увеличи разликата.
Шампионатът се върна в Европа и в Херес имаше трудно състезание за Маркес, който стана 7-и, на 2 сек. от лидерската група. Това бе най-слабото му състезание този сезон. Фенати спечели, но Милър бе лидер със 79 т., докато Маркес бе 5-и с 49. Милър се върна на върха в Льо Ман, а Ринс бе втори, докато Маркес стана 5-и и разликата между него и Джак набъбна. На Муджело Милър и Маркес бяха надолу заедно, но Маркес изоставаше с 44 т.
Барселона обаче бе бонус за Маркес,който на домашна територия спечели състезанието с повече от 3 сек. – една от най-големите разлики за сезона. Това бе връщането на младия брат Маркес в битката за титлата. На Ассен бе втората поредна победа на Маркес, докато Милър не завърши състезанието. Той обаче се върна на върха в Германия, където Маркес стана 4-и.
На Индианаполис Маркес отново бе на подиума, докато Милър бе 6-и. В средата на сезона, на това състезание Honda пусна новия си подобрен байк за Moto3, като сложи край на доминацията на КТМ. В Бърно Маркес бе пред Милър на подиума. Испанецът излезе на второ място в шампионата, но все още бе на 23 т. зад Милър. На Силвърстоун и Мизано, Маркес бе втори, след съотборника си Ринс, а Милър бе съответно 6-и и 3-и.
На Арагон Маркес върна надеждите си за титлата, след като битката си с Милър двамата имаха контакт. Джак фенешера 27-и, а пилотът на Honda стана втори и поведе в класирането. На Мотеги Маркес спечели състезанието, докато Милър и Дани Кент излязоха от трасето на последните завой. Маркес имаше 231 т., а Милър 206. На Филип Айлънд Милър се върна на върха за първи път след Заксенринг, а Маркес бе след него. Малайзия бе първото място, на което Маркес можеше да спечели титлата, но след една епична битка, испанецът стана 5-и, а Милър – втори. Разликата стана 11 т., с която пилотите дойдоха във Валенсия. Тук обаче Маркес стана шампион в Moto3 и сложи короната, за да отиде с нея през 2015 г. в Moto2.