Лидерът в шампионата на Moto2 Франко Морбидели (EG 0,0 Marc VDS) спечели първа позиция на Муджело за Гран При на Италия в последната минута. Той я измъкна от лидера до момента и негов съотборник Алекс Маркес само с 0.036 сек. Зад двамата пилоти, които единствени са печелили състезания в Moto2 през този сезон, се нареди ветеранът Матия Пасини (Italtrans Racing), който също ще стартира от първа редица нва домашната си Гран при.
Кандидатът за титлата Том Люти (CarXpert Interwetten) и Такаки Накагами (Idemitsu Honda Team Asia) са първи и втори на втора редица, с 4-о и 5-о време. Шести е Лука Марини (Forward Racing Team), който направи отлична квалификация.
Хорхе Наваро (Federal Oil Gresini Moto2) бе най-бързият новак и стана 7-и, а до него на 3-а редица са един от редовните пилоти на подиума Франческо Баная (Sky Racing Team VR46) и Лоренцо Балдасари (Forward Racing), който на тази писта спечели единствената си победа през 2016 г.
Мигел Оливейра (Red Bull KTM Ajo) стана 9-и, но се цели в нов подиум за шасито на KTM в средния клас, а италианският ветеран Симоне Корси (Speed Up Racing) стана 10-и и най-бързия с шаси Speed Up. На следващата редица 11-и е Реми Гарднер (Tech 3 Racing), въпреки че катастрофира, а до него е съотлорникът му Шави Виерге. Трети на редицата е световният шампион за 2015 в Moto3 Дани Кент (Iker Lecuona Garage Plus Interwetten).